Es una técnica que incorpora en el tubo de endoscopia un microaparato de ecografía en la punta. Permite el exámen ecorgáfico con alta resolución de la pared del esófago, estómago y duodeno, así como de órganos vecinos, como páncreas, vías biliares o ganglios linfáticos.  Es de gran utilidad para la toma de biopsias dirigidas y realización de procedimientos de tratamiento que permiten evitar en algunos casos la cirugía. 

La exploración se realiza bajo sedación. La ecoendoscopia diagnóstica se puede realizar de forma ambulatoria.  Cuando se realiza intervencionismo suele requerir hospitalización en régimen de corta estancia.